Судебная коллегия ВС РФ 3 октября 2018 г. отменила акты трех нижестоящих инстанций, которые ранее признали незаконными решение ФАС России об установлении НМТП монопольно высоких цен на перевалку грузов, а также два предписания ведомства с требованиями установить экономически обоснованные цены на услуги в рублях и перечислить в бюджет доход в размере 9,7 млрд руб., полученный, по мнению ФАС России, в результате нарушения закона.

Суды трех инстанций, однако, согласились с доводами НМТП о том, что анализ товарного рынка был проведен антимонопольным ведомством некорректно, в частности были неправильно определены географические границы рынка, в связи с чем неправильно сделан вывод о монопольном положении заявителя. Как пояснил в суде НМТП, в одном регионе с портом Новороссийска функционируют порты Туапсе, Керчи, украинские порты, поэтому НМТП не является монополистом. Порт также отметил, что государство отменило регулирование тарифов по причине имеющейся на рынке в данном регионе конкуренции.

СКЭС ВС РФ согласилась с выводами ФАС России о монопольном положении НМТП в порту Новороссийска, однако поручила нижестоящему суду при новом рассмотрении дополнительно исследовать вопрос о сумме дохода, полученного стивидором в результате нарушения антимонопольного законодательства.